Надин Лабаки родилась 18 февраля 1974 года в Ливане, городе Баадба, в семье христиан-маронитов Антуана и Антуанетт Лабаки. Старшая сестра актрисы и дизайнера Кэролайн Лабаки. Училась в университете Св. Иосифа в Бейруте (IESAV).
Её дипломный фильм 11 Rue Pasteur (1997), стал лучшим короткометражным фильмом на Биеннале арабских фильмов в парижском Институте арабского мира в 1998 году.
Она снимает видеоклипы для многих известных ливанских и арабских исполнителей, в том числе Pascale Machaalani, Noura Rahal, Katia Harb, Нэнси Аджрам. Также она снимает рекламные ролики для «Кока-колы». С 2003 года она снимается как актриса.
В 2007 году она сняла свой первый фильм «Карамель», премьера которого состоялась на Каннском кинофестивале. Фильм был тепло встречен критиками и понравился зрителям. Её второй фильм «И куда мы теперь?» вышел в 2011 году. Фильм был показан на Каннском кинофестивале 2011 в рамках программы «Особый взгляд» и с тех пор коллекционирует награды по всему миру. В 2011 году на Международном кинофестивале в Торонто фильм получил «Приз зрительских симпатий».
На местных выборах мая 2016 года Лабаки выдвигалась кандидатом от активистского политического движения «Бейрут — мой город», стоящего на платформе социальной справедливости и общественного блага, однако не была избрана.
В 2018 году как режиссёр и актриса сняла фильм «Капернаум», он был номинирован на премию «Оскар» 2019 года за лучший фильм на иностранном языке.
Лабаки замужем за музыкантом Халедом Музанаром. У них есть двое детей.
