Сиксу получила степень агреже по английскому языку в 1959 году и степень доктора наук в 1968 году. Её областью научных интересов в то время была английская литература и произведения Джеймса Джойса. Сиксу стала ассистентом в Университете Бордо в 1962 году, была старшим преподавателем в Сорбонне с 1965 по 1967 год, а в 1967 году была назначена на должность лектора в Университет Париж X — Нантер.
В 1968 году, после студенческих беспорядков, Сиксу было поручено основать Университет Париж 8, «созданный, чтобы служить альтернативой традиционной французской академической среде». В 1974 году она основала первый в Европе университетский центр для женских исследований. Сейчас Элен Сиксу преподаёт в Университете Париж 8 и Европейской аспирантуре в Зас-Фе, Швейцария.
