Мэттью Перри родился в Уильямстауне, Массачусетс 19 августа 1969 года. Его мать, журналистка Сьюзанн Мари Моррисон (урождённая Лэнгфорд), была пресс-секретарём премьер-министра Пьера Трюдо, а отец, Джон Беннетт Перри, — актёр и бывшая модель. Родители Мэттью развелись, когда будущему актёру не исполнилось и года, и вступили в новые браки. Отчимом Мэттью стал канадский диктор NBC Кит Моррисон, а после переезда к отцу мачехой — Дебби Перри.
Он вырос в Оттаве, Канада, где учился в средней школе Рокклифф-Парк и колледже Эшбери. В детстве занимался большим теннисом и занимал призовые места в соревнованиях юниоров.