Станислав Говорухин родился 29 марта 1936 года в городе Березники Свердловской области (ныне Пермский край). Родители: донской казак Сергей Георгиевич Говорухин и портниха Прасковья Афанасьевна Глазкова.
В 1958 году окончил геологический факультет Казанского государственного университета имени В. И. Ульянова-Ленина и около года работал геологом Средне-Волжского геологоразведочного управления. В 1959—1961 годах трудился редактором и ассистентом режиссёра на Казанской студии телевидения.
В 1966 году с отличием окончил режиссёрский факультет ВГИКа (мастерская Якова Сегеля). Дипломная работа — фильм «Тётя Катя».
