Родилась в Душанбе. Высшее образование получала в Москве, в 2005 окончила факультет истории искусств Российского Государственного Гуманитарного Университета (РГГУ). В 2010 году окончила Высшие курсы сценаристов и режиссеров, также получила диплом Института проблем современного искусства.
Первую режиссерскую работу Нигина Сайфуллаева сняла в 2009 году, это была короткометражка «Хочу с тобой», для этой ленты режиссер самостоятельно написала сценарий. В 2011 сняла вторую короткометражку, «Шиповник». В 2012 году Нигина стала одним из режиссеров комедийного сериала «Деффчонки», который показывал канал ТНТ.
В 2017 году Нигина выступила одним из сценаристов фильма «Про любовь. Только для взрослых», сняв там одну из новелл; в том же году написала сценарий для драматического сериала «Детки» для ТВ-3.
В 2018 году работала над новым фильмом, психологической драмой «Звезд неверный свет». Фильм повествует о женщине тридцати лет, которая подозревает мужа в измене, но не может прямо об этом сказать и сама решается на предательство. Первоначально фильм должен был называться «Ревность», но за два года работы над сценарием рабочее название фильма перестало в полной мере соответствовать его содержанию. Фильм под названием «Верность» был показан на фестивале «Кинотавр» в 2019 году и получил диплом от жюри с формулировкой «за безграничную веру актёров в режиссёра».
