Мария Кравченко родилась в городе Грозном. Окончила Саратовское художественное училище имени А. П. Боголюбова (скульптурное отделение, 1999), Саратовский государственный университет имени Н. Г. Чернышевского (социологический факультет, 2004) и ВГИК (режиссёрское отделение, мастерская Сергея Мирошниченко, 2008). Ещё в студенческие годы начала работать в качестве режиссёра и сценариста на Нижне-Волжской студии кинохроники и сотрудничать с телеканалом ТНТ.
Одной из наиболее заметных работ Марии Кравченко стал документальный фильм «Части Тела», снятый в 2009 году. Анализируя эту картину, кинокритик Кристина Матвиенко («Искусство кино») упомянула про «зону правды», которая приходится на простое признание: от войны все устали.
Дебютом Марии Кравченко в игровом кино стал фильм «Завтрак у папы», вышедший в 2016 году.
