Сергей Сельянов родился 21 августа 1955 года в Олонце (Карело-Финская ССР).
В 1972—1975 годах учился на строительном факультете в Тульского политехнического института, где снимал фильмы на любительской киностудии «Сад».
В 1980 году окончил сценарный факультет ВГИКа (мастерская Николая Фигуровского), в 1989 году — Высшие курсы сценаристов и режиссёров (мастерская Ролана Быкова).
В 1980 году совместно c Николаем Макаровым подпольно снял полнометражный фильм «День ангела» по одноимённому рассказу Михаила Коновальчука, в то время студента сценарного факультета ВГИКа. Проявка плёнки, монтаж и озвучание растянулись на много лет, фильмокопия была напечатана лишь в 1987 году. На экран фильм вышел в 1988 году.
В 1992 году организовал и возглавил кинокомпанию СТВ. Продюсер более 40 художественных и документальных фильмов, отмеченных на российских и международных кинофестивалях. Продюсер телепрограмм «Лицедеи. Железные бабки» (ОРТ, 1996), «Сто лет кинематографу России» (ОРТ, 1996), «Линия кино» (ОРТ, 1996—1999).
Лауреат ряда кинематографических премий. Интервью с Сергеем Сельяновым о проблемах кинематографа неоднократно публиковались в ведущих деловых печатных изданиях России. Экономический журнал «Эксперт» в феврале 2003 года назвал Сергея Сельянова «единственным российским продюсером, чьё имя стало брэндом в области кинопроизводства».
22 апреля 2004 года в рамках проекта Публичные лекции «Полит.ру» прочитал открытую лекцию «Сказки, сюжеты и сценарии современной России» (пятая лекция).
В марте 2013 года в журнале Forbes высказался против законопроектов Государственной думы, согласно которым предполагалось отменить льготы по НДС на выручку от проката иностранных фильмов в кинотеатрах России и установить квоты в размере 20 % на прокат фильмов российского производства. По мнению продюсера, данные законы в случае их принятия «приведут к культурной изоляции страны, росту цен на билеты и закрытию кинотеатров».
Председатель Правления Ассоциации продюсеров кино и телевидения России.
